企业办理境外投资备案需要多个部门的审批，这些部门主要包括国家发展和改革委员会（发改委）、商务部以及外汇管理部门。以下是详细的审批流程：

发改委审批

提交材料：企业需要向发改委提交项目相关信息，包括企业基本情况、项目情况、项目利用资源情况分析、对生态环境的影响分析以及对经济和社会的影响分析等。

审核与备案：发改委会对提交的材料进行审核，主要关注投资项目的合规性、真实性以及是否符合国家发展战略和产业政策。如符合条件，发改委将予以备案，并出具备案通知书。对于涉及敏感国家和地区、敏感行业的项目，发改委则需要进行核准管理。

商务部审批

提交材料：企业需向商务部提交包括投资主体信息、境外企业信息、投资项目信息等在内的相关资料。企业需要填写并打印《境外投资备案表》，并附加企业营业执照、投资决策文件、投资协议等相关附件。

审核与备案：商务部门会对提交的材料进行审核，主要关注投资主体、投资方式、投资目的地等。如符合要求，商务部门将予以备案，并颁发《企业境外投资证书》。对于涉及敏感国家和地区、敏感行业的项目，商务部则需要进行核准管理。

外汇管理部门备案

提交材料：企业需要填写并提交《外汇业务直接投资申请表》，以及商务部门颁发的《企业境外投资证书》等相关文件。

外汇登记：外汇管理部门会对投资资金进行监管，确保资金合规使用。企业需要办理境外直接投资外汇登记，外汇管理部门会对投资资金来源、投资金额、投资方式等进行审核和登记。此外，如果投资额度在500万美元以上，还需向外管部门报告。

此外，如果企业属于国有企业或投资涉及国有资产，还需要得到国有资产主管部门的审批备案或核准。对于金融行业企业，可能还需要向金融监管部门报备。

企业在申请境外投资时，应确保提交的材料真实、准确、完整，并且要与相关部门保持良好的沟通，及时了解政策变化和办理要求。同时，企业也应关注政策变化，及时调整投资策略，以实现海外投资的可持续发展。