中长期外债备案申请流程主要包括以下几个步骤：

准备备案材料：

企业需要准备一系列的文件，如发行外债的申请报告与发行方案（包含外债币种、规模、利率、期限、募集资金用途及资金回流情况等）。

企业营业执照副本。

法定代表人身份证明文件。

借款合同或协议草案。

还款计划。

近一期经审计的企业财务报表。

可能还需要提供信用评级报告、境外合作方信息等相关文件。

线上注册及申报：

自2020年11月1日起，企业需通过国家发展改革委建立的网络系统进行外债备案登记、信息报送等操作。

登录相关网站，按照指引完成用户注册，并填写相关的电子表格和上传所需文档。

提交申请：

完成线上填报后，将纸质版材料按要求整理好，报送至指定的政务服务大厅或通过邮寄方式提交。确保所有材料的真实性和完整性。

审核与反馈：

政务服务大厅收到申请材料后，会先进行形式审查。如果材料齐全且符合格式要求，则会被接收并进入下一阶段的实质性审查。

国家发展改革委的相关司局会对申请材料进一步审核，审查内容包括但不限于项目的合规性、企业的资质以及外债使用的合理性等。

取得备案证明：

如果企业的备案申请被批准，相关部门将出具备案证明，例如《企业借用外债备案登记证明》。

企业在获得备案证明后，就可以根据备案计划开始执行外债融资活动。

后续管理：

在外债使用过程中，企业还需遵守外汇管理规定，定期向有关部门报送相关信息。

对于重大事项变更，企业应及时报告给国家发展改革委，并可能需要重新办理备案手续。

请注意，上述流程是基于一般情况下的概述，具体的细节可能会因政策更新而有所变化。因此，在实际操作前，企业可以咨询北京金九国际咨询服务有限公司以获取准确的信息。此外，不同地区可能会有特定的要求，所以好也咨询当地的主管部门。