北京企业境外投资备案的办理流程主要包括准备材料、提交申请、审核备案、领取证书等步骤。以下是具体介绍：

准备材料：企业在办理境外投资备案前，需要准备相关材料，包括企业营业执照副本、公司章程、财务审计报告等基础文件。还需要填写《境外直接投资申请表》和撰写项目申请报告，后者应包含尽职调查、可行性研究报告、投资环境分析评价等内容。

提交申请：企业将准备好的材料提交给北京市商务局或国家发展和改革委员会，申请办理境外投资项目备案。

审核备案：相关部门对企业提交的材料进行审核，核实投资项目的合法性和真实性。如材料齐全、符合相关法规要求，则会进入下一步审批程序。

领取证书：审核通过后，企业到北京市政务服务中心或市商务委委托的地点领取《企业境外投资证书》和《境外投资项目备案通知书》。

总的来说，北京企业境外投资备案是一个涉及多个部门、多个步骤的过程，需要企业提前做好准备，确保材料齐全、合规，以顺利推进备案流程。