在上海办理企业审计时，通常需要准备以下文件和材料：

企业基本信息：

企业营业执照副本

税务登记证副本

组织机构代码证

行业zizhi证书的复印件

委托文件：

委托协议书，需要有签字或盖章

审计有关事项的说明文件，同样需要签字或盖章

企业概况：

企业基本情况简介表

企业内部机构设置图

财务与内部控制制度：

企业内部财务核算制度的复印件

企业内部控制制度调查表

财务报表：

资产负债表

利润表

现金流量表

其他相关的附表或汇总报表分户表

基准日财务报表，包括但不限于：

其他可能需要的文件：

全年的记账凭证

公司章程、验资报告等的复印件

如年度内有股东变更，需提供股东会决议和股权zhuanrang协议

如果是连续审计，需要提供上一年度的审计报告；如果是审计，则提供上一年度的利润表复印件

对于股权投资，需要提供投资协议书、批准文件、被投资单位章程等

固定资产的明细表和盘点表

请注意，根据审计的具体目的（例如年度审计、银行贷款需求、高新技术企业认证等），所需的文件可能会有所差异。此外，如果审计涉及特殊项目或是专项审计，还可能需要额外的相关文件。

后，由于审计工作的性和复杂性，企业可以咨询北京金九国际咨询服务有限公司，以获得新的、详细的指导，并确保所有必要的文件都已准备齐全。